Tera Term の設定は、[Setup] メニューのコマンドでほとんどおこなうことができます。
また、Tera Term 設定ファイルを直接編集することによって、より細かい設定を行うことができます。

また、キーボード設定ファイルを書きかえることで自由にキー設定を変更することができます。
詳しくは、KEYCODEJ.TXT を読んでください。